MacGyver er i London for å feire sin gamle venn Paul Moran. Men feiringen av Paul sin førtiårsdag blir plutselig snudd til tragedie, i det uidentifiserte menn skyter og dreper Paul, og kidnapper hans eneste datter. Tidligere KGB-agent MacGyver hiver seg på saken umiddelbart. Han får hjelp av en vakker, tidligere KGB-agent ved navn Natalia Krimm. Sammen er de snart på sporet av en internasjonal terroristgruppe med verdens mektigste våpen i sine hender.