Den første Contracted, der efterfølgende fik et 'Phase I' smækket på titlen, handlede om en stakkels ung pige, der fik tildraget sig en meget ubehagelig sygdom, der fik hele hendes krop til at gå i forfald. I denne opfølger, 'Phase II', har vi skiftet fokus til en ung mand, der ligeledes kommer uheldigt afsted. Riley (Matt Mercer) er blevet smittet, og han ved, at tiden er knap. Desperat prøver han at finde ud af mere om sygdommen, men truslen er måske større, end han er klar over. Kan hele menneskeheden være i fare, hvis sygdomme får frit spil?